Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms