Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TM7SF3Q9NS93 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms