Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms