Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms