Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms