Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LPIN3Q9BQK8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms