Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3CQ99985 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3CQ99985 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3CQ99985 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms