Protein–RNA interactions for Protein: Q96RR4

CAMKK2, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMKK2Q96RR4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAMKK2Q96RR4 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAMKK2Q96RR4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAMKK2Q96RR4 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAMKK2Q96RR4 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CAMKK2Q96RR4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAMKK2Q96RR4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAMKK2Q96RR4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms