Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms