Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC7Q96NW7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC7Q96NW7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC7Q96NW7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC7Q96NW7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC7Q96NW7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC7Q96NW7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC7Q96NW7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC7Q96NW7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC7Q96NW7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC7Q96NW7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC7Q96NW7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC7Q96NW7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC7Q96NW7 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms