Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD1Q96JS3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms