Protein–RNA interactions for Protein: Q96E40

SPACA9, Sperm acrosome-associated protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA9Q96E40 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPACA9Q96E40 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms