Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX21Q969T3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms