Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALLDQ8WX93 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms