Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms