Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MYRIPQ8NFW9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms