Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX3Q8N9I9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms