Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLF2Q8IX21 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms