Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms