Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVH2

FOXP4, Forkhead box protein P4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP4Q8IVH2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXP4Q8IVH2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXP4Q8IVH2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXP4Q8IVH2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXP4Q8IVH2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXP4Q8IVH2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXP4Q8IVH2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXP4Q8IVH2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXP4Q8IVH2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXP4Q8IVH2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXP4Q8IVH2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXP4Q8IVH2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXP4Q8IVH2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXP4Q8IVH2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXP4Q8IVH2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXP4Q8IVH2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXP4Q8IVH2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXP4Q8IVH2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXP4Q8IVH2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXP4Q8IVH2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXP4Q8IVH2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXP4Q8IVH2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXP4Q8IVH2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXP4Q8IVH2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXP4Q8IVH2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXP4Q8IVH2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXP4Q8IVH2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXP4Q8IVH2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXP4Q8IVH2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXP4Q8IVH2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXP4Q8IVH2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXP4Q8IVH2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXP4Q8IVH2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXP4Q8IVH2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXP4Q8IVH2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXP4Q8IVH2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXP4Q8IVH2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXP4Q8IVH2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms