Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms