Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PREX2Q70Z35 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms