Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP34Q70CQ2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP34Q70CQ2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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