Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FGD6Q6ZV73 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms