Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU64

CFAP65, Cilia- and flagella-associated protein 65, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP65Q6ZU64 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP65Q6ZU64 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CFAP65Q6ZU64 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CFAP65Q6ZU64 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CFAP65Q6ZU64 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CFAP65Q6ZU64 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms