Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms