Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABRAXAS1Q6UWZ7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABRAXAS1Q6UWZ7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABRAXAS1Q6UWZ7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms