Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP17L2Q6R6M4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms