Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLX4IPQ5VYV7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms