Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHYHD1Q5SRE7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms