Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms