Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBE3CQ15386 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms