Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
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