Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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