Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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C1orf61Q13536 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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C1orf61Q13536 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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C1orf61Q13536 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms