Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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