Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAD4Q13485 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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