Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM32Q13049 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM32Q13049 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM32Q13049 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM32Q13049 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM32Q13049 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM32Q13049 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM32Q13049 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM32Q13049 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM32Q13049 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM32Q13049 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM32Q13049 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM32Q13049 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM32Q13049 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM32Q13049 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM32Q13049 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM32Q13049 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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TRIM32Q13049 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM32Q13049 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM32Q13049 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM32Q13049 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM32Q13049 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM32Q13049 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM32Q13049 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM32Q13049 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
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TRIM32Q13049 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM32Q13049 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM32Q13049 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM32Q13049 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM32Q13049 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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TRIM32Q13049 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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TRIM32Q13049 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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TRIM32Q13049 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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TRIM32Q13049 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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TRIM32Q13049 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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TRIM32Q13049 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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TRIM32Q13049 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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