Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRDM2Q13029 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
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