Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
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ARHGEF5Q12774 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
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ARHGEF5Q12774 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF5Q12774 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms