Protein–RNA interactions for Protein: Q12765

SCRN1, Secernin-1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN1Q12765 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCRN1Q12765 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCRN1Q12765 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCRN1Q12765 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SCRN1Q12765 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SCRN1Q12765 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SCRN1Q12765 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCRN1Q12765 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCRN1Q12765 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SCRN1Q12765 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCRN1Q12765 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SCRN1Q12765 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCRN1Q12765 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCRN1Q12765 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCRN1Q12765 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms