Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFFO1Q0D2I5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms