Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSRP1Q08945 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms