Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms