Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4BQ07343 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms