Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms