Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIM1P81133 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIM1P81133 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIM1P81133 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIM1P81133 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIM1P81133 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIM1P81133 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIM1P81133 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIM1P81133 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIM1P81133 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIM1P81133 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIM1P81133 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIM1P81133 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIM1P81133 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIM1P81133 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIM1P81133 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SIM1P81133 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIM1P81133 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIM1P81133 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIM1P81133 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIM1P81133 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIM1P81133 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIM1P81133 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIM1P81133 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIM1P81133 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SIM1P81133 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIM1P81133 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIM1P81133 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIM1P81133 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIM1P81133 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIM1P81133 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIM1P81133 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIM1P81133 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIM1P81133 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIM1P81133 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIM1P81133 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIM1P81133 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIM1P81133 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIM1P81133 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIM1P81133 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIM1P81133 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIM1P81133 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SIM1P81133 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIM1P81133 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIM1P81133 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIM1P81133 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIM1P81133 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIM1P81133 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIM1P81133 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIM1P81133 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIM1P81133 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIM1P81133 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIM1P81133 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SIM1P81133 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SIM1P81133 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SIM1P81133 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SIM1P81133 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SIM1P81133 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SIM1P81133 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SIM1P81133 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SIM1P81133 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIM1P81133 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SIM1P81133 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIM1P81133 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIM1P81133 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIM1P81133 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIM1P81133 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIM1P81133 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIM1P81133 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIM1P81133 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIM1P81133 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIM1P81133 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIM1P81133 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIM1P81133 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIM1P81133 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIM1P81133 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIM1P81133 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIM1P81133 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIM1P81133 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIM1P81133 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIM1P81133 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIM1P81133 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIM1P81133 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIM1P81133 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIM1P81133 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIM1P81133 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIM1P81133 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIM1P81133 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIM1P81133 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIM1P81133 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SIM1P81133 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIM1P81133 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIM1P81133 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SIM1P81133 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIM1P81133 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIM1P81133 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIM1P81133 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIM1P81133 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SIM1P81133 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIM1P81133 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms