Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AFDNP55196 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AFDNP55196 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
AFDNP55196 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
AFDNP55196 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AFDNP55196 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AFDNP55196 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AFDNP55196 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AFDNP55196 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AFDNP55196 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AFDNP55196 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AFDNP55196 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AFDNP55196 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AFDNP55196 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
AFDNP55196 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AFDNP55196 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
AFDNP55196 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
AFDNP55196 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
AFDNP55196 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AFDNP55196 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AFDNP55196 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AFDNP55196 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AFDNP55196 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AFDNP55196 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AFDNP55196 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AFDNP55196 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AFDNP55196 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AFDNP55196 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AFDNP55196 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AFDNP55196 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
AFDNP55196 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AFDNP55196 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AFDNP55196 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
AFDNP55196 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AFDNP55196 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AFDNP55196 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
AFDNP55196 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
AFDNP55196 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AFDNP55196 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
AFDNP55196 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AFDNP55196 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AFDNP55196 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AFDNP55196 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AFDNP55196 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AFDNP55196 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AFDNP55196 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AFDNP55196 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AFDNP55196 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
AFDNP55196 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AFDNP55196 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AFDNP55196 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AFDNP55196 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AFDNP55196 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AFDNP55196 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AFDNP55196 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AFDNP55196 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AFDNP55196 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AFDNP55196 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AFDNP55196 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AFDNP55196 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AFDNP55196 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AFDNP55196 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AFDNP55196 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AFDNP55196 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AFDNP55196 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AFDNP55196 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AFDNP55196 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
AFDNP55196 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
AFDNP55196 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AFDNP55196 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AFDNP55196 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AFDNP55196 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
AFDNP55196 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AFDNP55196 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AFDNP55196 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AFDNP55196 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AFDNP55196 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AFDNP55196 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AFDNP55196 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AFDNP55196 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AFDNP55196 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AFDNP55196 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AFDNP55196 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AFDNP55196 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AFDNP55196 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AFDNP55196 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AFDNP55196 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AFDNP55196 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AFDNP55196 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AFDNP55196 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AFDNP55196 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AFDNP55196 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AFDNP55196 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AFDNP55196 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AFDNP55196 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AFDNP55196 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AFDNP55196 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AFDNP55196 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AFDNP55196 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AFDNP55196 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms