Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
SMARCA2P51531 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms