Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAMP50895 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAMP50895 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAMP50895 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAMP50895 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAMP50895 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAMP50895 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAMP50895 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAMP50895 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAMP50895 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAMP50895 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAMP50895 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAMP50895 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
BCAMP50895 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCAMP50895 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCAMP50895 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCAMP50895 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCAMP50895 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCAMP50895 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCAMP50895 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BCAMP50895 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BCAMP50895 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCAMP50895 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCAMP50895 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCAMP50895 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCAMP50895 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BCAMP50895 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCAMP50895 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCAMP50895 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCAMP50895 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BCAMP50895 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCAMP50895 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCAMP50895 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCAMP50895 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCAMP50895 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BCAMP50895 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCAMP50895 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCAMP50895 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCAMP50895 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCAMP50895 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAMP50895 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAMP50895 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAMP50895 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAMP50895 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAMP50895 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAMP50895 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAMP50895 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAMP50895 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAMP50895 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAMP50895 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAMP50895 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAMP50895 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAMP50895 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAMP50895 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAMP50895 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAMP50895 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAMP50895 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAMP50895 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAMP50895 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAMP50895 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAMP50895 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAMP50895 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAMP50895 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAMP50895 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAMP50895 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAMP50895 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAMP50895 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAMP50895 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAMP50895 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAMP50895 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAMP50895 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAMP50895 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAMP50895 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAMP50895 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAMP50895 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAMP50895 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAMP50895 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAMP50895 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAMP50895 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAMP50895 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAMP50895 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAMP50895 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAMP50895 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAMP50895 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAMP50895 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAMP50895 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAMP50895 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAMP50895 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAMP50895 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAMP50895 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAMP50895 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAMP50895 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAMP50895 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAMP50895 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAMP50895 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAMP50895 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAMP50895 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAMP50895 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAMP50895 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAMP50895 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms